Краевой центр вакцинопрофилактики создан департаментом здравоохранения Приморского края (ДЗПК) с целью максимального охвата профилактическими прививками взрослого населения, детей и подростков Приморского края, снижения заболеваемости вакциноуправляемыми инфекциями и предотвращения эпидемиологических вспышек.
Располагается на базе ГУЗ «Приморский краевой диагностический центр», является его структурным подразделением, с непосредственным подчинением департаменту здравоохранения Приморского края. Возглавляется руководителем центра с непосредственным подчинением ДЗПК и главному врачу Приморского краевого диагностического центра.